128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5187 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1273    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  43.49 
 
 		 642 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  44.07 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  44.82 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  43.01 
 
 		 450 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  43.39 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  42.82 
 
 		 448 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  40.29 
 
 		 1245 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  38.65 
 
 		 366 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  35.65 
 
 		 377 aa  167  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  35.79 
 
 		 833 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4557  putative Ig  42.34 
 
 		 926 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0762461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  36.76 
 
 		 382 aa  137  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  30.64 
 
 		 445 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1744 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  40.78 
 
 		 179 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.95 
 
 		 312 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.8 
 
 		 1762 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  32.66 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.11 
 
 		 339 aa  94.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1557 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.58 
 
 		 776 aa  91.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.19 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  32.19 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  29.64 
 
 		 795 aa  84  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  25.89 
 
 		 990 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  27.81 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  28.63 
 
 		 717 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  33.33 
 
 		 993 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 1009 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  32.9 
 
 		 1009 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  32.9 
 
 		 1017 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  33.19 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  36.26 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.2 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  26.63 
 
 		 1567 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  28.42 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  29.44 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  36.44 
 
 		 3563 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  27.87 
 
 		 1656 aa  74.3  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  25.62 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  26.95 
 
 		 344 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  28.4 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.99 
 
 		 1222 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  29.48 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  30.6 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  26.47 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1407 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32786  predicted protein  28.15 
 
 		 660 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.61 
 
 		 1453 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.45 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.22 
 
 		 757 aa  67.4  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  32.07 
 
 		 1232 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  29.74 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  26.56 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  35.25 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  26.56 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  24.36 
 
 		 909 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3372  Ig family protein  43.9 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  24.36 
 
 		 947 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.62 
 
 		 693 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  28.78 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  28.81 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  25.1 
 
 		 1461 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  30.19 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  23.84 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.8 
 
 		 2402 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 858 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 858 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  24.38 
 
 		 807 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  24.01 
 
 		 805 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  24.01 
 
 		 858 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  24.01 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  24.01 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 954 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.9 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  25.52 
 
 		 1000 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  23.08 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.51 
 
 		 1451 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  28.02 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  35.96 
 
 		 1672 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.67 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 2942 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.11 
 
 		 692 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  32.45 
 
 		 698 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  21.61 
 
 		 396 aa  54.3  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.63 
 
 		 3542 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  39.19 
 
 		 935 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  25.07 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  25.64 
 
 		 671 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.53 
 
 		 11716 aa  52  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  31.25 
 
 		 3911 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  24.73 
 
 		 910 aa  50.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  22.79 
 
 		 339 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  38.53 
 
 		 759 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>