55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0752 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 368 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1557 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.32 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  29.77 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  28.08 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  24.41 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  30.57 
 
 		 1017 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1009 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  30.77 
 
 		 1009 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  22.13 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  25.79 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.73 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  24.77 
 
 		 667 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  24.28 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  23.93 
 
 		 993 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  27.1 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 		 642 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.34 
 
 		 776 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  27.41 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  24 
 
 		 795 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.23 
 
 		 990 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1762 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  29.55 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  28.03 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  21.94 
 
 		 698 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  28.21 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 		 812 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  32.37 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29.59 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  26.29 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  24.44 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1514 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.91 
 
 		 1656 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  27.84 
 
 		 321 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.15 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.15 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 		 693 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  29.36 
 
 		 162 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  24 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  22.89 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  24.55 
 
 		 314 aa  47  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.47 
 
 		 1453 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.41 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.41 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 2942 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  23.68 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.5 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  23.56 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  24.55 
 
 		 632 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  23.81 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.74 
 
 		 725 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>