37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0493 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 376 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  58.61 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  49.56 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  47.08 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  45.51 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  65.43 
 
 		 162 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0398  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  27.74 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1762 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  25.87 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  24.17 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 471 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.89 
 
 		 693 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.97 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  24.88 
 
 		 812 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  21.05 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  27.45 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1514 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 1009 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  28.12 
 
 		 1009 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.98 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.98 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  28.12 
 
 		 1017 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  21.05 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  28.12 
 
 		 993 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  22.78 
 
 		 990 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  26.54 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  28.18 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  27.45 
 
 		 970 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  25.96 
 
 		 710 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  24.46 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.53 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1557 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.53 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>