102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2665 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 693 aa  1392    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  97.51 
 
 		 970 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  59.27 
 
 		 1193 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  47.92 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  41.49 
 
 		 812 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  42.91 
 
 		 1069 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  39.1 
 
 		 990 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  62.82 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  37.95 
 
 		 795 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  45.16 
 
 		 1206 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  48.98 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  46.62 
 
 		 1392 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  46.21 
 
 		 1236 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.26 
 
 		 1424 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.67 
 
 		 1762 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  44.6 
 
 		 1295 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  34.19 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.79 
 
 		 341 aa  106  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  35.43 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  34.14 
 
 		 317 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  32.18 
 
 		 321 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  38.12 
 
 		 2142 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  38.26 
 
 		 1479 aa  97.1  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  27.68 
 
 		 344 aa  94.7  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  30.53 
 
 		 445 aa  94.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  28.82 
 
 		 373 aa  94  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  32.18 
 
 		 321 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  37.79 
 
 		 1465 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.21 
 
 		 1687 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 776 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  34.64 
 
 		 1193 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  37.42 
 
 		 850 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1557 aa  84  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.4 
 
 		 1451 aa  77.8  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  26.9 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  31.52 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 		 1453 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  30.45 
 
 		 993 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1407 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  27.49 
 
 		 1656 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  31.5 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  28.21 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  28.3 
 
 		 1017 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 471 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 1009 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.92 
 
 		 1009 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.62 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  35.56 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.23 
 
 		 1108 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.88 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  40.62 
 
 		 631 aa  67.8  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 		 1201 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  30.99 
 
 		 180 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.77 
 
 		 1455 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  34 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  24.65 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  27.93 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.62 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  35.38 
 
 		 346 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  28.07 
 
 		 430 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1514 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  27.55 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  36.36 
 
 		 336 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.35 
 
 		 717 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  27.6 
 
 		 280 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  34.36 
 
 		 642 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  32.35 
 
 		 236 aa  54.7  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 358 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  28.46 
 
 		 366 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  33.64 
 
 		 1119 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.64 
 
 		 624 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  23.91 
 
 		 353 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  31.34 
 
 		 339 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  31.32 
 
 		 667 aa  52.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  24.12 
 
 		 725 aa  51.6  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.41 
 
 		 636 aa  51.2  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 2942 aa  50.8  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.02 
 
 		 646 aa  50.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  25.63 
 
 		 335 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  26.89 
 
 		 588 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  27.89 
 
 		 376 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  38.71 
 
 		 639 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  28.82 
 
 		 327 aa  48.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  27.69 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.37 
 
 		 392 aa  47.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  31.01 
 
 		 396 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  28.28 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  23.62 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  32.23 
 
 		 557 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.23 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  32.29 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.23 
 
 		 392 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>