128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3370 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 
642 aa  1246    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  40.09 
 
 
586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  41.69 
 
 
646 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  38.34 
 
 
366 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  41.27 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  37.5 
 
 
605 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  41.49 
 
 
484 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  32.77 
 
 
377 aa  153  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  41.18 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.39 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  33.33 
 
 
1245 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  38.7 
 
 
833 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  32.34 
 
 
382 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.2 
 
 
1762 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  31.94 
 
 
339 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.71 
 
 
1557 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  29.47 
 
 
312 aa  91.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  38.33 
 
 
179 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  31.05 
 
 
776 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  30.21 
 
 
1744 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  32.15 
 
 
487 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  30.31 
 
 
795 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  30.67 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
1009 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  32.55 
 
 
1009 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  32.55 
 
 
1017 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.24 
 
 
993 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  31.5 
 
 
1407 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  26.77 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.71 
 
 
990 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  30.25 
 
 
321 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  24.94 
 
 
1656 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  27.8 
 
 
341 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.23 
 
 
717 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  31.9 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.42 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.92 
 
 
812 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  29.51 
 
 
373 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.96 
 
 
2942 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  27.96 
 
 
180 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  28.51 
 
 
326 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25.2 
 
 
471 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
454 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  34.93 
 
 
318 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  26.72 
 
 
1461 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
461 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  49.52 
 
 
662 aa  61.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2387  hypothetical protein  48.46 
 
 
528 aa  60.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  decreased coverage  0.00128177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  24.12 
 
 
334 aa  60.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  33.03 
 
 
514 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  33.82 
 
 
483 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  27.54 
 
 
236 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  32.31 
 
 
154 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.57 
 
 
663 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  39.25 
 
 
644 aa  57.4  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  24.9 
 
 
368 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  27.4 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 
726 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  28.44 
 
 
336 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32786  predicted protein  29.95 
 
 
660 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  31.3 
 
 
593 aa  53.9  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  39 
 
 
2886 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  31.58 
 
 
607 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.27 
 
 
497 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  23.94 
 
 
488 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 
858 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 
858 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  36.67 
 
 
1736 aa  52  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.48 
 
 
1215 aa  52  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  26.38 
 
 
807 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  36.43 
 
 
806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  31.54 
 
 
667 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  25.53 
 
 
858 aa  51.2  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  33.98 
 
 
1428 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  25.53 
 
 
805 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.21 
 
 
1222 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  25.53 
 
 
800 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  25.53 
 
 
800 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  37.5 
 
 
1029 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  31.76 
 
 
2239 aa  50.4  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  28.41 
 
 
339 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.958191 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.98 
 
 
1364 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  25.78 
 
 
314 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.28 
 
 
1453 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  25.65 
 
 
1567 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  23.85 
 
 
918 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.05 
 
 
693 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  26.36 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  36.84 
 
 
897 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
954 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
1556 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
1451 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  36.84 
 
 
797 aa  48.5  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  24.76 
 
 
321 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  32.04 
 
 
1424 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  34.21 
 
 
1802 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  31.21 
 
 
757 aa  47.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  25.97 
 
 
335 aa  47.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  23.51 
 
 
517 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>