79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3230 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  100 
 
 
1245 aa  2426    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  40.38 
 
 
605 aa  182  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  37.82 
 
 
646 aa  159  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  33.78 
 
 
366 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  34.26 
 
 
450 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  32.74 
 
 
586 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  33.98 
 
 
642 aa  134  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  34.59 
 
 
484 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  47.25 
 
 
833 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  34.3 
 
 
448 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  31.9 
 
 
377 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  31.16 
 
 
382 aa  100  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  30.68 
 
 
1744 aa  99.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  40.14 
 
 
179 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  36.41 
 
 
487 aa  72  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  29.12 
 
 
797 aa  70.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  23.53 
 
 
1567 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  35.08 
 
 
6272 aa  69.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  24.3 
 
 
1222 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.18 
 
 
1394 aa  59.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  26.84 
 
 
918 aa  58.9  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  29.63 
 
 
909 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  27.42 
 
 
781 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  42.67 
 
 
892 aa  57.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  23.76 
 
 
445 aa  57.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  29.63 
 
 
947 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  31.97 
 
 
638 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.33 
 
 
1490 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  35.14 
 
 
757 aa  57.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  27.42 
 
 
781 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  31.34 
 
 
536 aa  57  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  32.41 
 
 
154 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  31.06 
 
 
1316 aa  55.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  26.4 
 
 
1762 aa  55.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  27.86 
 
 
667 aa  55.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  31.11 
 
 
593 aa  55.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 
858 aa  55.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 
858 aa  55.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  25.35 
 
 
800 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  25.35 
 
 
800 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  25.95 
 
 
334 aa  53.5  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  25.35 
 
 
858 aa  54.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  25.35 
 
 
805 aa  53.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  25.95 
 
 
807 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.03 
 
 
597 aa  53.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  29.36 
 
 
831 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.43 
 
 
363 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  30.39 
 
 
759 aa  52.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  27.63 
 
 
180 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
752 aa  49.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  33.8 
 
 
466 aa  49.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  25.88 
 
 
483 aa  49.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  24.92 
 
 
776 aa  49.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  36.07 
 
 
1124 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  42.86 
 
 
1241 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  21.75 
 
 
671 aa  49.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  24.71 
 
 
339 aa  49.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  34.29 
 
 
1275 aa  48.9  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  23.33 
 
 
812 aa  48.5  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.1 
 
 
726 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  28.04 
 
 
517 aa  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  41.89 
 
 
526 aa  48.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  41.56 
 
 
490 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  42.65 
 
 
439 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  35.11 
 
 
791 aa  47  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  31.69 
 
 
1009 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  48.28 
 
 
1695 aa  45.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.43 
 
 
1776 aa  45.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4720  hypothetical protein  30.99 
 
 
473 aa  45.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0071  hypothetical protein  31.74 
 
 
1034 aa  45.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  41.56 
 
 
490 aa  45.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  31.68 
 
 
575 aa  45.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  32.43 
 
 
806 aa  45.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>