66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0447 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0447  kelch  100 
 
 		 382 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  36.5 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  32.45 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  37.39 
 
 		 605 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  38.46 
 
 		 586 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  35.83 
 
 		 646 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  37.63 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  37.81 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  32.34 
 
 		 642 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  36.75 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  31.16 
 
 		 1245 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  34.02 
 
 		 833 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  31.05 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  37.01 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1744 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 776 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.02 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1557 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  30.82 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  24.91 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.12 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.72 
 
 		 2942 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  32.04 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  29.38 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1762 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  33.57 
 
 		 717 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29.91 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  27.97 
 
 		 487 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  31.62 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  26.84 
 
 		 508 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  31.08 
 
 		 909 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  31.08 
 
 		 947 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  27.7 
 
 		 1222 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  31.21 
 
 		 781 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  21.2 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  37.93 
 
 		 781 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  28.22 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  29.19 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.75 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  40.98 
 
 		 667 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  30.6 
 
 		 993 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  28.89 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.23 
 
 		 795 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  24.52 
 
 		 593 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  27.59 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 461 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  27.91 
 
 		 831 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  35.37 
 
 		 759 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  29.05 
 
 		 800 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  29.05 
 
 		 805 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  24.35 
 
 		 1656 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  29.05 
 
 		 800 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  29.05 
 
 		 858 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  37.36 
 
 		 667 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4720  hypothetical protein  33.83 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 858 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 858 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  30.08 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80234  carboxymethyltransferase  28.46 
 
 		 692 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  28.71 
 
 		 757 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  41.25 
 
 		 433 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.27 
 
 		 693 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  27.17 
 
 		 517 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  28.07 
 
 		 797 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>