67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3595 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  100 
 
 
833 aa  1652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  55.79 
 
 
1189 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  50.82 
 
 
1126 aa  180  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  43.67 
 
 
924 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  38.73 
 
 
605 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  48.89 
 
 
1117 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  36.65 
 
 
484 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  36.08 
 
 
448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  47.22 
 
 
847 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  41.95 
 
 
673 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  46.99 
 
 
1182 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  48.33 
 
 
1083 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  35.88 
 
 
366 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  44.2 
 
 
968 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  35.22 
 
 
450 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  35.74 
 
 
646 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  43.96 
 
 
974 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  43.55 
 
 
709 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  47.25 
 
 
1245 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  37.82 
 
 
642 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  31.71 
 
 
377 aa  121  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  31.21 
 
 
586 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  37.59 
 
 
331 aa  105  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  36.32 
 
 
1744 aa  104  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  35.96 
 
 
332 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  36.03 
 
 
332 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  34.02 
 
 
382 aa  93.6  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1233  Ig domain-containing protein  34.6 
 
 
619 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.154947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  28.38 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3516  hypothetical protein  51.22 
 
 
691 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  41.58 
 
 
1115 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  33.13 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  55.38 
 
 
164 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.36 
 
 
445 aa  65.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  27.68 
 
 
433 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  45.65 
 
 
687 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  45.65 
 
 
687 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  32.17 
 
 
154 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0451  Ig-like, group 2  41.11 
 
 
770 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  24.65 
 
 
312 aa  54.7  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  23.15 
 
 
339 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  26.32 
 
 
321 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  57.45 
 
 
265 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  25.65 
 
 
781 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  26.13 
 
 
1762 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2774  hypothetical protein  42.68 
 
 
691 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  25.65 
 
 
781 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3592  hypothetical protein  33.82 
 
 
743 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_006686  CND03470  expressed protein  30.67 
 
 
1146 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  26.67 
 
 
593 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  30.16 
 
 
909 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  30.16 
 
 
947 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  30.25 
 
 
341 aa  48.5  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  33.66 
 
 
757 aa  47.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  22.39 
 
 
1222 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  31.78 
 
 
806 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  37.66 
 
 
831 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  25.76 
 
 
483 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2009  hypothetical protein  37.08 
 
 
115 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38923  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  24.05 
 
 
1567 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  31.58 
 
 
638 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  24.35 
 
 
488 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 
858 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 
858 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.99 
 
 
344 aa  44.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  32.23 
 
 
807 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
776 aa  44.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>