43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2670 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  100 
 
 
924 aa  1830    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  49.74 
 
 
968 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  43.45 
 
 
769 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  46.7 
 
 
1189 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  52.14 
 
 
1083 aa  251  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  42.66 
 
 
673 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  42.96 
 
 
974 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  45.45 
 
 
1117 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  44.29 
 
 
709 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  45.45 
 
 
1126 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  44.89 
 
 
1182 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  40.89 
 
 
847 aa  188  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  43.67 
 
 
833 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  55.88 
 
 
164 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  28.41 
 
 
406 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  25.21 
 
 
506 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.04 
 
 
1762 aa  60.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00813  conserved kelch repeat protein TeaB (Eurofung)  26.51 
 
 
713 aa  58.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  42.86 
 
 
572 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42836  predicted protein  24.76 
 
 
347 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  30.94 
 
 
358 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27.96 
 
 
1067 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  37.74 
 
 
892 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  24.83 
 
 
445 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  40.74 
 
 
575 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  40.74 
 
 
575 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  39.56 
 
 
638 aa  49.7  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
1556 aa  48.5  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  40.26 
 
 
490 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  40.26 
 
 
490 aa  48.9  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  38.71 
 
 
1180 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.36 
 
 
752 aa  48.5  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  25.12 
 
 
312 aa  48.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
1776 aa  47.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07370  sporulation-related protein, putative  29.22 
 
 
1073 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.428501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  28.71 
 
 
497 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02090  Kelch repeats protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04970)  25.27 
 
 
677 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  34.72 
 
 
449 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.03 
 
 
3027 aa  45.8  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  35.4 
 
 
1316 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  22.74 
 
 
990 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94478  predicted protein  32.35 
 
 
323 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  32.69 
 
 
905 aa  44.3  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>