19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0764 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  100 
 
 
769 aa  1469    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  43.45 
 
 
924 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  42.69 
 
 
850 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  43.75 
 
 
570 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  36.41 
 
 
912 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  51.85 
 
 
521 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.57 
 
 
522 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  51.19 
 
 
480 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.19 
 
 
818 aa  65.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  42.86 
 
 
120 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.36 
 
 
821 aa  64.7  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4752  hypothetical protein  41.03 
 
 
498 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0299934  normal  0.0968587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  40.54 
 
 
119 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  42.2 
 
 
119 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  46.59 
 
 
446 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  36.22 
 
 
655 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  31.52 
 
 
539 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 
615 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  48.1 
 
 
688 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>