31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2465 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  62.76 
 
 		 799 aa  766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  100 
 
 		 905 aa  1764    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  36.15 
 
 		 892 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  35.36 
 
 		 1316 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  31.39 
 
 		 1281 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  34.77 
 
 		 572 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  30.8 
 
 		 575 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  34.32 
 
 		 575 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.57 
 
 		 752 aa  154  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  32.76 
 
 		 466 aa  145  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  26.39 
 
 		 1361 aa  127  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.42 
 
 		 1279 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  35.45 
 
 		 526 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  29.5 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  28.76 
 
 		 1180 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  28.04 
 
 		 449 aa  108  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  25.98 
 
 		 4630 aa  95.5  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  26.1 
 
 		 649 aa  94  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  42.54 
 
 		 316 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.59 
 
 		 1776 aa  77.4  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  25.27 
 
 		 1821 aa  62.4  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  25.44 
 
 		 1300 aa  61.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  34.86 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  35.54 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  44.32 
 
 		 482 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.91 
 
 		 1009 aa  48.5  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  46.15 
 
 		 490 aa  47  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  28.89 
 
 		 472 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  37.5 
 
 		 683 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  28.89 
 
 		 472 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>