36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1908 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  100 
 
 
968 aa  1910    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  49.74 
 
 
924 aa  347  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  47.98 
 
 
1189 aa  314  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  55.6 
 
 
974 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  57.3 
 
 
1117 aa  306  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  53.85 
 
 
673 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  56 
 
 
1083 aa  271  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  47.08 
 
 
1182 aa  230  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  44.6 
 
 
709 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  45.68 
 
 
1126 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  43 
 
 
847 aa  214  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  44.2 
 
 
833 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  60 
 
 
164 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  31.21 
 
 
1672 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.29 
 
 
1673 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.67 
 
 
1394 aa  60.1  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.41 
 
 
1879 aa  57.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  41.57 
 
 
618 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 
692 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  31.79 
 
 
891 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
878 aa  53.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  43.06 
 
 
1222 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  34.48 
 
 
443 aa  52.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  33.88 
 
 
1626 aa  52  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  33.33 
 
 
813 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  35.45 
 
 
638 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  43.55 
 
 
1232 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  35.53 
 
 
1170 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  32.67 
 
 
1129 aa  48.9  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
1272 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 
3911 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  35.29 
 
 
1123 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.57 
 
 
3027 aa  46.2  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  25 
 
 
311 aa  45.8  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  28.64 
 
 
1199 aa  45.8  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  27.85 
 
 
2375 aa  45.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>