57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0185 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  100 
 
 		 813 aa  1611    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  55.76 
 
 		 891 aa  247  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  32.79 
 
 		 2990 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1879 aa  126  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  26.26 
 
 		 892 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  25.24 
 
 		 1150 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1351 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  26.18 
 
 		 1168 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  26.95 
 
 		 941 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  25.96 
 
 		 917 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  34.15 
 
 		 1232 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  33.33 
 
 		 1672 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  39.31 
 
 		 940 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.99 
 
 		 1673 aa  94.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  35.96 
 
 		 1222 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.12 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  24.81 
 
 		 940 aa  80.9  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30.27 
 
 		 3911 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  31.01 
 
 		 1544 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  27.91 
 
 		 916 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  42.2 
 
 		 1626 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.55 
 
 		 878 aa  71.2  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.62 
 
 		 1272 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  40.2 
 
 		 1129 aa  68.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  50 
 
 		 1394 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  41.67 
 
 		 2375 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  35.23 
 
 		 1123 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  30.52 
 
 		 2876 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  31.34 
 
 		 2890 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  35.11 
 
 		 618 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.09 
 
 		 3542 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  49.02 
 
 		 1337 aa  55.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  49.02 
 
 		 1337 aa  55.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  37.84 
 
 		 5517 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  46.15 
 
 		 1153 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  46.15 
 
 		 1153 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  33.58 
 
 		 3373 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  35.29 
 
 		 2112 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  32.99 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  33.33 
 
 		 968 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  49.09 
 
 		 5544 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  31.19 
 
 		 965 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  31.19 
 
 		 965 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  36.04 
 
 		 2802 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  29.66 
 
 		 311 aa  47.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  33.04 
 
 		 892 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  46 
 
 		 1727 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.84 
 
 		 815 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.31 
 
 		 3699 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.77 
 
 		 3699 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 471 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0172  hypothetical protein  40 
 
 		 398 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  30.3 
 
 		 443 aa  45.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0743  hypothetical protein  31.68 
 
 		 446 aa  44.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0128528  decreased coverage  0.00133596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  35.16 
 
 		 436 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 5203 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>