254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3185 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  100 
 
 
1129 aa  2233    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  47.68 
 
 
835 aa  290  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  61.17 
 
 
500 aa  247  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  56.86 
 
 
1518 aa  247  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.57 
 
 
1687 aa  244  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  38.68 
 
 
743 aa  242  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.09 
 
 
784 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  40.39 
 
 
778 aa  237  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  60.87 
 
 
461 aa  234  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  60.96 
 
 
637 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  60.53 
 
 
1625 aa  231  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.53 
 
 
818 aa  230  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.89 
 
 
821 aa  226  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  59.04 
 
 
568 aa  225  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  38.44 
 
 
792 aa  224  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  38.82 
 
 
911 aa  221  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  53.93 
 
 
533 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.5 
 
 
776 aa  213  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.88 
 
 
837 aa  209  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  37.54 
 
 
461 aa  208  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36.61 
 
 
2082 aa  207  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  38.57 
 
 
717 aa  204  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.35 
 
 
1679 aa  204  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.43 
 
 
1919 aa  201  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  37.36 
 
 
461 aa  198  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.75 
 
 
469 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  40.64 
 
 
593 aa  191  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  40.76 
 
 
681 aa  189  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.99 
 
 
417 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36 
 
 
714 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  51.85 
 
 
657 aa  183  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  36.23 
 
 
363 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  36.23 
 
 
363 aa  179  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.95 
 
 
554 aa  175  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.84 
 
 
556 aa  175  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  31.94 
 
 
807 aa  175  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  41.78 
 
 
376 aa  175  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  38.37 
 
 
551 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  37.23 
 
 
726 aa  174  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.52 
 
 
555 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  40.9 
 
 
389 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.43 
 
 
706 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  38.6 
 
 
477 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.28 
 
 
1848 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.6 
 
 
561 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  40.87 
 
 
579 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  46.39 
 
 
601 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.81 
 
 
553 aa  168  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.36 
 
 
563 aa  167  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  42.72 
 
 
617 aa  164  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  40.66 
 
 
558 aa  164  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  39.47 
 
 
569 aa  164  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  36.61 
 
 
449 aa  164  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
745 aa  162  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  39.07 
 
 
560 aa  161  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  35.64 
 
 
737 aa  159  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  37.04 
 
 
553 aa  158  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.88 
 
 
638 aa  154  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.26 
 
 
570 aa  152  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  35.92 
 
 
558 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  34.22 
 
 
403 aa  149  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.46 
 
 
567 aa  149  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  34.36 
 
 
547 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  36.99 
 
 
546 aa  145  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.09 
 
 
1222 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  31.26 
 
 
575 aa  142  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  34.78 
 
 
577 aa  141  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.67 
 
 
1126 aa  141  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  35.26 
 
 
554 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  31.91 
 
 
597 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.66 
 
 
555 aa  135  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  34.25 
 
 
443 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  36.25 
 
 
624 aa  124  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.93 
 
 
900 aa  123  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  34.52 
 
 
566 aa  122  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.31 
 
 
810 aa  118  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.32 
 
 
692 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  30.18 
 
 
618 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  28.86 
 
 
341 aa  104  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  27.29 
 
 
1207 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.05 
 
 
787 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.6 
 
 
454 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.31 
 
 
921 aa  99  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  29.38 
 
 
396 aa  95.5  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  24.28 
 
 
558 aa  93.2  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.7 
 
 
817 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.5 
 
 
450 aa  93.2  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.04 
 
 
1147 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  27.67 
 
 
1187 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  28.21 
 
 
602 aa  85.1  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.45 
 
 
692 aa  84  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.42 
 
 
643 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  28.62 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  23.09 
 
 
728 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  29.71 
 
 
1408 aa  82  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.29 
 
 
941 aa  82  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  27.53 
 
 
544 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  28.44 
 
 
643 aa  79.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.14 
 
 
209 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  27.3 
 
 
371 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>