103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3178 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 1518 aa  2976    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  48.62 
 
 		 500 aa  291  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  65 
 
 		 568 aa  279  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  65.08 
 
 		 533 aa  277  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.9 
 
 		 1687 aa  276  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  63.92 
 
 		 637 aa  264  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  65.22 
 
 		 461 aa  260  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  60.91 
 
 		 1625 aa  259  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  56.86 
 
 		 1129 aa  248  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  58.33 
 
 		 657 aa  207  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3348  hypothetical protein  32.9 
 
 		 913 aa  198  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  51.05 
 
 		 617 aa  191  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  46.73 
 
 		 601 aa  179  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  24.04 
 
 		 4630 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1351 aa  73.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  30.48 
 
 		 1131 aa  68.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  30.48 
 
 		 1131 aa  68.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  24.48 
 
 		 1800 aa  66.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  27.46 
 
 		 980 aa  65.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  26.69 
 
 		 845 aa  65.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  31.03 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  31.75 
 
 		 697 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  24.18 
 
 		 1801 aa  63.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  29.5 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  31.46 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  21.43 
 
 		 2272 aa  62.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1727 aa  61.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  30.95 
 
 		 266 aa  61.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  28.12 
 
 		 738 aa  60.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  30.99 
 
 		 272 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  30.47 
 
 		 2178 aa  61.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  28.68 
 
 		 804 aa  60.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  28.77 
 
 		 219 aa  59.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  30.77 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.86 
 
 		 1029 aa  59.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  29.38 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  28.77 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  21.82 
 
 		 2179 aa  58.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.75 
 
 		 742 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  29.56 
 
 		 458 aa  57  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  25.6 
 
 		 5517 aa  57  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  27.62 
 
 		 218 aa  56.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  29.56 
 
 		 383 aa  56.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  27.62 
 
 		 218 aa  56.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  29.56 
 
 		 383 aa  56.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  27.62 
 
 		 218 aa  56.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  29.56 
 
 		 383 aa  56.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  28.64 
 
 		 272 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  22.66 
 
 		 932 aa  55.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  28.96 
 
 		 818 aa  55.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  28.57 
 
 		 220 aa  55.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  29.52 
 
 		 272 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  28.78 
 
 		 404 aa  54.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  27.8 
 
 		 376 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  28.57 
 
 		 268 aa  53.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  28.57 
 
 		 268 aa  53.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  27.05 
 
 		 218 aa  53.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.7 
 
 		 461 aa  52.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  29.3 
 
 		 577 aa  52.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  29.36 
 
 		 578 aa  52.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  29.3 
 
 		 577 aa  52.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  28.64 
 
 		 578 aa  52.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  26.83 
 
 		 376 aa  52  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  29.58 
 
 		 578 aa  52  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.79 
 
 		 461 aa  52  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  28.12 
 
 		 1821 aa  52  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  30.32 
 
 		 461 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  30.32 
 
 		 461 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.51 
 
 		 2656 aa  51.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.79 
 
 		 461 aa  52  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  30.83 
 
 		 484 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  27.8 
 
 		 880 aa  50.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  30.14 
 
 		 444 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  28.84 
 
 		 578 aa  51.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  28.35 
 
 		 489 aa  51.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  28.44 
 
 		 502 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  28.57 
 
 		 492 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  32.97 
 
 		 1202 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  27.24 
 
 		 727 aa  49.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  28.57 
 
 		 492 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  24.62 
 
 		 754 aa  49.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  26.18 
 
 		 522 aa  49.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  28.57 
 
 		 510 aa  48.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  28.57 
 
 		 510 aa  48.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  28.57 
 
 		 510 aa  48.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  22.82 
 
 		 1337 aa  48.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  22.82 
 
 		 1337 aa  48.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  26 
 
 		 1729 aa  48.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  22.02 
 
 		 2110 aa  48.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  27.91 
 
 		 578 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2098  S-layer protein, missing N-terminal  30.06 
 
 		 332 aa  48.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000493722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  23.99 
 
 		 5203 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  25.95 
 
 		 2136 aa  48.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  28 
 
 		 586 aa  47.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 		 640 aa  47  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  28.04 
 
 		 577 aa  46.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  27.52 
 
 		 577 aa  46.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>