33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  100 
 
 		 738 aa  1402    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  44.67 
 
 		 804 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  32.94 
 
 		 845 aa  264  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  31.31 
 
 		 980 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  36.45 
 
 		 2148 aa  121  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  31.88 
 
 		 1057 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1024  Cna B domain protein  31.66 
 
 		 2332 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  32.8 
 
 		 1053 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  27.68 
 
 		 1157 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  26.8 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  30.14 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  24.52 
 
 		 1167 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  27.06 
 
 		 812 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  28.74 
 
 		 2656 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  26.21 
 
 		 894 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  27.64 
 
 		 1518 aa  50.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  32.05 
 
 		 447 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  29.5 
 
 		 2474 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  25.78 
 
 		 1424 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  31.16 
 
 		 443 aa  48.5  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 943 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  24.39 
 
 		 1034 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  26.45 
 
 		 1073 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  28.07 
 
 		 409 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  26.32 
 
 		 1804 aa  47.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 		 1215 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  27.57 
 
 		 1202 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  31.65 
 
 		 727 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  33.13 
 
 		 690 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 		 2182 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  27.79 
 
 		 3373 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.17 
 
 		 753 aa  44.3  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.22 
 
 		 1710 aa  44.3  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>