More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2393 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  100 
 
 
522 aa  1073    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  29.25 
 
 
880 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  34.68 
 
 
548 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  33.71 
 
 
660 aa  87  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  28.74 
 
 
758 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.48 
 
 
843 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  30.73 
 
 
625 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.75 
 
 
1821 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  35.43 
 
 
876 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.98 
 
 
1016 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  29.14 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  32.1 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  30.86 
 
 
1194 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.57 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.57 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  29.61 
 
 
657 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  35.71 
 
 
218 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.57 
 
 
575 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.13 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  32.11 
 
 
1154 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.13 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.93 
 
 
567 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.66 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.66 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.17 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.13 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.25 
 
 
1174 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.57 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  28.38 
 
 
575 aa  73.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3361  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.76 
 
 
575 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  30.95 
 
 
820 aa  73.6  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  30.73 
 
 
914 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  30.17 
 
 
1208 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  28.57 
 
 
939 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  28.73 
 
 
1729 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3089  S-layer protein  33.9 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.706009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  27.62 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3311  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.9 
 
 
591 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3033  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  33.9 
 
 
591 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  31.43 
 
 
620 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  31.43 
 
 
620 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  30.81 
 
 
733 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.32 
 
 
1260 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  29.49 
 
 
1226 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2982  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  33.33 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  29.55 
 
 
2375 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  30.71 
 
 
620 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.21 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00112193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  31.79 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  31.79 
 
 
579 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  31.79 
 
 
578 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  29.19 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.21 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  29.19 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  26.95 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.21 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  30.99 
 
 
1223 aa  67.8  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  28.42 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  29.69 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  32.39 
 
 
599 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.39 
 
 
599 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  28.25 
 
 
1847 aa  67.4  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3295  S-layer protein, putative  33.33 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  27.59 
 
 
857 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  31.63 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  30.77 
 
 
615 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  26.69 
 
 
594 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  30.73 
 
 
932 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.45 
 
 
529 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  26.15 
 
 
535 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.57 
 
 
2073 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  26.01 
 
 
921 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  27.47 
 
 
1457 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  26.15 
 
 
535 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  24.89 
 
 
530 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  29.06 
 
 
360 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  29.06 
 
 
360 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  28.98 
 
 
863 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  29.06 
 
 
360 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  26.41 
 
 
585 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  29.06 
 
 
360 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  30.43 
 
 
189 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  27.88 
 
 
546 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  27.37 
 
 
547 aa  63.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  27.27 
 
 
538 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  27.5 
 
 
379 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  31.01 
 
 
461 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  27.4 
 
 
383 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  30.47 
 
 
360 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  27.4 
 
 
383 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  23.33 
 
 
3320 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.48 
 
 
529 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  28.33 
 
 
604 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.96 
 
 
529 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  27.4 
 
 
383 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  27.17 
 
 
548 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.99 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.53 
 
 
529 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.99 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>