254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1481 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.64 
 
 
1442 aa  752    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  36.06 
 
 
1504 aa  822    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  49.46 
 
 
1538 aa  1312    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  44.91 
 
 
1727 aa  1064    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  32.15 
 
 
1366 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  80.22 
 
 
2168 aa  3330    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  100 
 
 
2110 aa  4283    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.54 
 
 
1750 aa  709    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  42.24 
 
 
1738 aa  1076    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  87.64 
 
 
1758 aa  3081    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  40.46 
 
 
1812 aa  860    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  32.86 
 
 
1340 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  39.57 
 
 
1551 aa  903    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  35.19 
 
 
1323 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  39.38 
 
 
1579 aa  835    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  48.55 
 
 
1801 aa  589  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  30.12 
 
 
1318 aa  582  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  50.91 
 
 
1800 aa  556  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  30.74 
 
 
1336 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.58 
 
 
2065 aa  526  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  31.26 
 
 
1281 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  31 
 
 
1300 aa  520  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  30.81 
 
 
1281 aa  510  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  27.99 
 
 
1244 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  28.56 
 
 
1220 aa  482  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.16 
 
 
1222 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  30.47 
 
 
1193 aa  456  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  28.33 
 
 
1258 aa  453  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  30.44 
 
 
1222 aa  453  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  28.57 
 
 
1266 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  29.86 
 
 
1237 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.08 
 
 
1209 aa  446  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  29.46 
 
 
1207 aa  446  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.1 
 
 
1152 aa  446  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  29.62 
 
 
1206 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  29.25 
 
 
1212 aa  439  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  27.83 
 
 
1259 aa  440  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  28.08 
 
 
1406 aa  438  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  30.24 
 
 
1207 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  30.38 
 
 
1190 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.11 
 
 
1213 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  29.2 
 
 
1191 aa  437  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  29.82 
 
 
1205 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  30.1 
 
 
1198 aa  430  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  30.03 
 
 
1198 aa  430  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.82 
 
 
1192 aa  430  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  30.03 
 
 
1198 aa  430  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  29.63 
 
 
1194 aa  426  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  28.48 
 
 
1263 aa  426  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.57 
 
 
1255 aa  426  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  27.32 
 
 
1302 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  28 
 
 
1244 aa  423  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  28.25 
 
 
1298 aa  424  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  29.53 
 
 
1196 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  30.26 
 
 
1199 aa  423  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  27.77 
 
 
1435 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  29.3 
 
 
1242 aa  422  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  27.87 
 
 
1256 aa  422  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  27.76 
 
 
1203 aa  419  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  27.76 
 
 
1293 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  27.72 
 
 
1409 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  28.98 
 
 
1250 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  29.28 
 
 
1187 aa  419  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  29.61 
 
 
1187 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  28.56 
 
 
1261 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.92 
 
 
2113 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  28.2 
 
 
1364 aa  413  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  29.74 
 
 
1250 aa  414  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  27.62 
 
 
1247 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.08 
 
 
1253 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  29.09 
 
 
1293 aa  410  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  28.9 
 
 
1288 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  26.3 
 
 
1281 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  27.82 
 
 
1247 aa  403  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  27.48 
 
 
1257 aa  400  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  26.18 
 
 
1267 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  26.21 
 
 
1281 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  27.74 
 
 
1254 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  27.92 
 
 
1254 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  26.39 
 
 
1285 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  29.4 
 
 
1229 aa  396  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  26.2 
 
 
1248 aa  396  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  26.59 
 
 
1273 aa  393  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  27.08 
 
 
1253 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  27.88 
 
 
1341 aa  394  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  26.98 
 
 
1267 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  26.21 
 
 
1281 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  28.28 
 
 
1266 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  28.03 
 
 
1333 aa  394  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  27.1 
 
 
1280 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  27.29 
 
 
1248 aa  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  26.54 
 
 
1220 aa  390  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  26.98 
 
 
1269 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  28.38 
 
 
1328 aa  390  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  26.55 
 
 
1273 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  26.87 
 
 
1290 aa  390  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  27.13 
 
 
1330 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  26.54 
 
 
1220 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  26.54 
 
 
1220 aa  390  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  26.54 
 
 
1220 aa  390  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>