27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1023 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  100 
 
 
980 aa  1867    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  48.18 
 
 
845 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  27.67 
 
 
804 aa  181  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  30.59 
 
 
738 aa  172  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1024  Cna B domain protein  36.39 
 
 
2332 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  28.18 
 
 
2148 aa  88.2  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  31.32 
 
 
1057 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.22 
 
 
1053 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  31.16 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  26.32 
 
 
447 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  25.97 
 
 
1157 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  29.61 
 
 
443 aa  58.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  27.55 
 
 
1518 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  39.74 
 
 
727 aa  55.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  24.56 
 
 
1167 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4143  hypothetical protein  26.5 
 
 
773 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4169  hypothetical protein  26.81 
 
 
773 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.10155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1895  hypothetical protein  26.8 
 
 
928 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123518  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4027  hypothetical protein  26.25 
 
 
773 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
1578 aa  48.1  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  31.25 
 
 
2474 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  25.96 
 
 
476 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  27.03 
 
 
490 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  30.53 
 
 
1424 aa  45.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  30.09 
 
 
1800 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  30.09 
 
 
1801 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  29.85 
 
 
1202 aa  45.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>