89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3311 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 
742 aa  1406    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.28 
 
 
633 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0852  hypothetical protein  34.77 
 
 
633 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0897  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.89 
 
 
633 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.91 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  23.1 
 
 
1202 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  29.5 
 
 
926 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.39 
 
 
4761 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  28.33 
 
 
773 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4143  hypothetical protein  27.81 
 
 
773 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
491 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  27.2 
 
 
812 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  35.71 
 
 
2148 aa  55.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4169  hypothetical protein  28.12 
 
 
773 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.10155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.96 
 
 
2182 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
392 aa  53.9  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.74 
 
 
753 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 
547 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 
496 aa  52  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 
496 aa  52  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  24.19 
 
 
1518 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 
434 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
747 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  31.87 
 
 
450 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  36.36 
 
 
1109 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
446 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  37 
 
 
538 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  25.88 
 
 
845 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4027  hypothetical protein  32.35 
 
 
773 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.77 
 
 
1126 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  30.77 
 
 
444 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  37 
 
 
549 aa  49.3  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  30.43 
 
 
428 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
449 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  37 
 
 
550 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  34.72 
 
 
478 aa  49.3  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
410 aa  48.5  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  33.33 
 
 
439 aa  48.9  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.58 
 
 
1501 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  25.3 
 
 
482 aa  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2771  hypothetical protein  29.91 
 
 
235 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0188969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  30.95 
 
 
1122 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  23.4 
 
 
2065 aa  48.5  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30.95 
 
 
1120 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 
379 aa  48.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
438 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  35.87 
 
 
532 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  31.03 
 
 
444 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  34.38 
 
 
609 aa  47.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  34.15 
 
 
966 aa  47.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.1 
 
 
1710 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  35.87 
 
 
535 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.69 
 
 
1489 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  26.33 
 
 
727 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  34.07 
 
 
431 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 
429 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  31.87 
 
 
453 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  25.5 
 
 
2474 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 
442 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
957 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  31.03 
 
 
444 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 
383 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2892  hypothetical protein  23.51 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  32.61 
 
 
458 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15451  hypothetical protein  32.43 
 
 
196 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  30.34 
 
 
462 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 
456 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  34.41 
 
 
427 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
436 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
440 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
440 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  28.09 
 
 
433 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  32.97 
 
 
444 aa  45.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
409 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
436 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  23.17 
 
 
482 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  29.35 
 
 
545 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.01 
 
 
1215 aa  44.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 
478 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  32.61 
 
 
434 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  28.43 
 
 
488 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
447 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  27.96 
 
 
1072 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0234  peptidase S41  33.33 
 
 
469 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  29.35 
 
 
426 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  29.67 
 
 
444 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  31.87 
 
 
440 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
440 aa  43.9  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
1041 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>