16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  100 
 
 		 2148 aa  4080    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1024  Cna B domain protein  40.05 
 
 		 2332 aa  353  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  36.56 
 
 		 738 aa  134  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  31.48 
 
 		 845 aa  80.1  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  28.48 
 
 		 980 aa  77.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 804 aa  62  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  31.44 
 
 		 6272 aa  60.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.71 
 
 		 742 aa  55.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  28.99 
 
 		 1202 aa  50.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  30.84 
 
 		 1490 aa  49.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  29.05 
 
 		 3373 aa  48.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  29.85 
 
 		 773 aa  48.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  22.12 
 
 		 3333 aa  47.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.85 
 
 		 1331 aa  47.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 938 aa  47  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>