More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1034 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  42.77 
 
 		 946 aa  703    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  42.18 
 
 		 972 aa  705    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  41.61 
 
 		 919 aa  675    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 938 aa  1917    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  62.98 
 
 		 962 aa  1168    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 936 aa  403  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 943 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 961 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 901 aa  356  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 917 aa  347  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 941 aa  344  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 942 aa  337  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 944 aa  335  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  30.63 
 
 		 838 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 943 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.92 
 
 		 972 aa  320  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 842 aa  313  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 935 aa  304  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 853 aa  304  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 836 aa  301  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 945 aa  291  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1001 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 917 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 991 aa  250  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 746 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 932 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1004 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 920 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.32 
 
 		 992 aa  188  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 933 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 889 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 927 aa  158  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 924 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 922 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 931 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 894 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 862 aa  141  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 915 aa  140  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 933 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 919 aa  138  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 908 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 986 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 1051 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1090 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 957 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 859 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 918 aa  121  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 976 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1077 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 875 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 931 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 948 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 878 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 878 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 942 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 878 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 940 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 878 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  29.07 
 
 		 940 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 921 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 958 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 939 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 939 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27.59 
 
 		 941 aa  108  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 988 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 926 aa  107  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 912 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 918 aa  107  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 988 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 927 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 914 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 888 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 962 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 951 aa  104  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 951 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 951 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 950 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 881 aa  101  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 934 aa  101  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 875 aa  101  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 880 aa  101  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  28.75 
 
 		 986 aa  101  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 892 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1007 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 943 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 601 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 906 aa  99.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.93 
 
 		 908 aa  98.6  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 998 aa  98.6  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 958 aa  98.2  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1003 aa  97.8  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  26.94 
 
 		 1109 aa  97.8  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  37.32 
 
 		 897 aa  97.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 1011 aa  97.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 1008 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1036 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 911 aa  96.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 922 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>