248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00302 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 746 aa  1524    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  64.74 
 
 		 853 aa  1005    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 901 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 945 aa  340  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 842 aa  333  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  31.81 
 
 		 838 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 936 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 917 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 941 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 943 aa  317  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 942 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 944 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 836 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 935 aa  284  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  29.76 
 
 		 972 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 938 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 946 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 962 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 919 aa  204  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 961 aa  197  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 943 aa  184  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 915 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 972 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 880 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 859 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 875 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 888 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 885 aa  137  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 868 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 875 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 868 aa  135  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.73 
 
 		 992 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 894 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 977 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 881 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 993 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 921 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 912 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 958 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 908 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 986 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 984 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 906 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 918 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 994 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 922 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 976 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 889 aa  115  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 906 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  31.06 
 
 		 927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  22.09 
 
 		 908 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 1074 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 925 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 951 aa  111  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 951 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 951 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 943 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 947 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  30.5 
 
 		 918 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 948 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 911 aa  108  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 988 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 988 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.76 
 
 		 1109 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 936 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  26.35 
 
 		 919 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  28.88 
 
 		 968 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 936 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 938 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 1097 aa  105  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 914 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 901 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 945 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 918 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 908 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 926 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 878 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 878 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 878 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 878 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 934 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27.44 
 
 		 941 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 950 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 944 aa  99  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  28.82 
 
 		 954 aa  98.2  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 945 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 958 aa  97.8  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 838 aa  97.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 908 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 889 aa  97.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 929 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 978 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  22.13 
 
 		 908 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 940 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  22.13 
 
 		 908 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 939 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 939 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1007 aa  95.1  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 934 aa  94.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>