More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04688 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 918 aa  1890    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 889 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.45 
 
 		 838 aa  187  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 917 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 836 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 842 aa  150  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 894 aa  149  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 941 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 942 aa  147  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 943 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 944 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 972 aa  144  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  25.36 
 
 		 897 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 945 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 915 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 875 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 935 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 880 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 888 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 938 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 948 aa  119  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 746 aa  117  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 859 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 951 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 951 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 951 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 927 aa  108  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 961 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 875 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 922 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 912 aa  95.1  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 862 aa  94.7  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 918 aa  93.6  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 921 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 853 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 977 aa  92  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 946 aa  91.3  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 868 aa  90.9  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 868 aa  89.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 945 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 936 aa  89.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.14 
 
 		 972 aa  88.6  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 926 aa  88.2  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  21.5 
 
 		 986 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 990 aa  87  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 904 aa  84.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 878 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 987 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 878 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 878 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 878 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 947 aa  81.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  22.23 
 
 		 838 aa  82  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 958 aa  80.5  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 963 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 978 aa  79.7  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  26.64 
 
 		 927 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.31 
 
 		 908 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.05 
 
 		 968 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.35 
 
 		 970 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 914 aa  76.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 943 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.03 
 
 		 992 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 934 aa  74.7  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1001 aa  74.7  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 936 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 936 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 1083 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  25.63 
 
 		 1109 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 885 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 881 aa  72.8  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  22.36 
 
 		 978 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  22.66 
 
 		 941 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 925 aa  71.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 962 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 906 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1158 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1008 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1097 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 901 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 945 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 990 aa  68.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 964 aa  68.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 939 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 986 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 1047 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 939 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  21.78 
 
 		 940 aa  67  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 943 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 902 aa  66.6  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 977 aa  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 908 aa  65.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 883 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 883 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>