254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0181 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  42.72 
 
 		 919 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  53.22 
 
 		 906 aa  905    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  42.86 
 
 		 908 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  42.86 
 
 		 908 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  42.64 
 
 		 908 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 911 aa  1832    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 908 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  41.75 
 
 		 924 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  41.09 
 
 		 908 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  42.34 
 
 		 906 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  42.9 
 
 		 921 aa  668    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 945 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  36.83 
 
 		 918 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 938 aa  499  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 943 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 946 aa  442  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 971 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 967 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 974 aa  396  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 976 aa  354  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  30.13 
 
 		 940 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 988 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 908 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 988 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  30.76 
 
 		 942 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 939 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 939 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 940 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  30.01 
 
 		 941 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1010 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1007 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 1016 aa  295  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 921 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 912 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  31.21 
 
 		 836 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 885 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  28.2 
 
 		 960 aa  285  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  28.21 
 
 		 959 aa  281  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 904 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 901 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 894 aa  237  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 918 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 915 aa  230  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1097 aa  220  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 914 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 859 aa  211  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 948 aa  210  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 929 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 927 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 958 aa  203  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 961 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 931 aa  201  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  25.13 
 
 		 970 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 984 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 951 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 951 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 951 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 926 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 892 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 967 aa  182  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 880 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 874 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 934 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 900 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 922 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  37.63 
 
 		 312 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 919 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 923 aa  172  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 1074 aa  169  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 881 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 880 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 984 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 838 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 882 aa  166  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 936 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 950 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 924 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 936 aa  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 998 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 998 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 920 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 998 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  28.39 
 
 		 1109 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 987 aa  152  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 944 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 902 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 888 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 836 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1046 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 963 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 943 aa  135  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 918 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 1035 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.45 
 
 		 986 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 1017 aa  131  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1013 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 1011 aa  127  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>