More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1535 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  70.79 
 
 		 946 aa  1390    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  42.7 
 
 		 938 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  42.4 
 
 		 962 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  62.31 
 
 		 919 aa  1171    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 972 aa  1994    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 942 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 941 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 944 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 917 aa  370  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 943 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 961 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 943 aa  362  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 901 aa  362  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 936 aa  360  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  29.38 
 
 		 972 aa  349  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 836 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  31.29 
 
 		 838 aa  343  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 945 aa  333  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 842 aa  332  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 853 aa  317  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1001 aa  295  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 935 aa  294  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 1004 aa  257  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 917 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 920 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 932 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 991 aa  227  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 746 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 875 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 924 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 904 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.13 
 
 		 992 aa  183  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 933 aa  164  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 948 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 892 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 918 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 880 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 862 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 934 aa  152  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 931 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 915 aa  148  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 885 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 859 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 1051 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 929 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 918 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 927 aa  133  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  21.97 
 
 		 962 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1003 aa  128  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 931 aa  124  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1090 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 894 aa  118  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 921 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 912 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 897 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 1035 aa  115  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 919 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  29.08 
 
 		 908 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 900 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  32.18 
 
 		 1109 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 922 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 914 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 908 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  29.08 
 
 		 908 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 976 aa  105  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 957 aa  105  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1077 aa  104  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 878 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 882 aa  104  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 978 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 878 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 838 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 951 aa  103  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 878 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 878 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 951 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 951 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 870 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 889 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 988 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 908 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 922 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 958 aa  99  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 906 aa  98.6  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 988 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 875 aa  98.2  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 881 aa  98.2  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 868 aa  97.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 868 aa  96.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 927 aa  97.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1036 aa  97.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 856 aa  95.9  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 998 aa  95.9  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 887 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 986 aa  95.9  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 887 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 994 aa  95.9  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.54 
 
 		 970 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  27.25 
 
 		 927 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>