More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3857 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1077 aa  2203    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1090 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 1051 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 933 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 924 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 931 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 962 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 957 aa  234  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 897 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1003 aa  205  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 856 aa  186  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  23.02 
 
 		 894 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  25.97 
 
 		 929 aa  173  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 897 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 927 aa  164  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 957 aa  151  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 917 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 920 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 916 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 938 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 991 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 888 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1004 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 922 aa  115  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 972 aa  112  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 962 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 897 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 888 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 932 aa  105  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 919 aa  102  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 946 aa  99.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 1001 aa  99  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 892 aa  98.6  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 936 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 917 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.31 
 
 		 972 aa  97.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1094 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 945 aa  94  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 944 aa  89.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 943 aa  88.6  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  24.42 
 
 		 872 aa  88.2  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 901 aa  87.4  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 941 aa  87  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 943 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 942 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1163 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1165 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 961 aa  82.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1127 aa  81.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 836 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 842 aa  80.1  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 1090 aa  79.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  29.69 
 
 		 838 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1152 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1113 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 1094 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1147 aa  72  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1130 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 1166 aa  72.4  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1168 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1148 aa  72  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1066 aa  71.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1109 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1142 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 935 aa  70.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1106 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 1146 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 952 aa  70.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 1089 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1102 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1129 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1079 aa  68.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 1211 aa  68.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1145 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 853 aa  68.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1219 aa  68.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 862 aa  67.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 914 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1096 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1095 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.31 
 
 		 992 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 892 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1153 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1096 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1148 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 957 aa  65.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1198 aa  65.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 1014 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 947 aa  65.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 894 aa  65.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1076 aa  65.1  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1119 aa  64.7  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 1164 aa  64.7  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1087 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 888 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1129 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1138 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>