193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0313 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  58.88 
 
 		 892 aa  993    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 897 aa  1810    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  57.74 
 
 		 897 aa  966    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 888 aa  467  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 894 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 897 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 916 aa  277  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 856 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 888 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  28.06 
 
 		 929 aa  242  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1003 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 924 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 957 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 957 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 933 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 1090 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 927 aa  176  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 931 aa  164  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 920 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 1077 aa  130  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 962 aa  104  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1051 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 922 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 917 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 932 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 936 aa  74.7  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 917 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 943 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 942 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 944 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 941 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 842 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 880 aa  68.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 972 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.88 
 
 		 838 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  33.91 
 
 		 972 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 938 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 746 aa  62  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 881 aa  61.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 931 aa  61.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 962 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.64 
 
 		 1109 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.59 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 914 aa  58.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 915 aa  57.4  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 878 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 1004 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 875 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 878 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 878 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 929 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 889 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 878 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 961 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 894 aa  55.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 866 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 892 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  29.32 
 
 		 639 aa  54.7  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 982 aa  54.3  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 906 aa  53.9  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 908 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.48 
 
 		 992 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 918 aa  53.9  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 935 aa  53.9  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 982 aa  54.3  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 872 aa  53.9  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 958 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 859 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  28.83 
 
 		 968 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 984 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 601 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1097 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 885 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 945 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 874 aa  52.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1001 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.53 
 
 		 647 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 990 aa  52  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 911 aa  52  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 888 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  28.26 
 
 		 908 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 908 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  28.4 
 
 		 986 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 904 aa  51.6  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 918 aa  51.6  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  28.26 
 
 		 908 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 649 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 621 aa  51.2  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 977 aa  51.2  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  24.07 
 
 		 959 aa  51.2  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 987 aa  51.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 998 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 994 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 802 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>