234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1988 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1003 aa  2014    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 924 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 957 aa  383  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 933 aa  327  8.000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 962 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 931 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 957 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 894 aa  301  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 897 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 916 aa  282  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1090 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 856 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 927 aa  270  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 888 aa  267  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 897 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 888 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 892 aa  256  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 1051 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 897 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  25.84 
 
 		 929 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 922 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 1077 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 920 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 917 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 962 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 991 aa  104  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 938 aa  104  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 932 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 972 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  29.91 
 
 		 972 aa  93.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 936 aa  88.6  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 943 aa  88.2  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 944 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1001 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 901 aa  85.9  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 917 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 942 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 961 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 941 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 943 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 945 aa  79  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.52 
 
 		 838 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 836 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1004 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 842 aa  77  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 919 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 946 aa  75.5  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 853 aa  73.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 935 aa  68.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 958 aa  68.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1097 aa  67.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 914 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 904 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  28.87 
 
 		 897 aa  66.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 746 aa  64.3  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.13 
 
 		 1109 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 979 aa  62.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 892 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 990 aa  61.2  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 943 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 901 aa  61.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 931 aa  60.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 964 aa  60.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 881 aa  60.1  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 889 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 894 aa  60.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 938 aa  59.3  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 946 aa  58.9  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  35.29 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.68 
 
 		 992 aa  58.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  29.65 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1008 aa  57.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 945 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 908 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 925 aa  57  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 919 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  30.08 
 
 		 906 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1035 aa  56.2  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 951 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 951 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 951 aa  56.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 757 aa  55.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 878 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.78 
 
 		 918 aa  55.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 978 aa  55.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1074 aa  55.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 994 aa  55.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 1036 aa  55.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 921 aa  55.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 862 aa  55.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 760 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2646  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 790 aa  54.7  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 961 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 957 aa  54.3  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>