239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02733 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 897 aa  1820    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 862 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 977 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 914 aa  161  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 945 aa  157  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 943 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 942 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 853 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 941 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 944 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 918 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 927 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 1035 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 904 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 961 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 984 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 917 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 836 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  38.51 
 
 		 838 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 842 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 901 aa  99  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 885 aa  97.8  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 943 aa  97.4  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 938 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  37.32 
 
 		 972 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 868 aa  96.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 946 aa  93.6  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 962 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 972 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 868 aa  93.2  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 894 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 919 aa  92.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 945 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 746 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 936 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.27 
 
 		 992 aa  85.5  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1036 aa  85.1  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 925 aa  84.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1013 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 947 aa  84  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 936 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 936 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 881 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 875 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 926 aa  81.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 961 aa  81.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 934 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1047 aa  81.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 951 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1097 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1008 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1011 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 902 aa  80.9  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 931 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1017 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 870 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 951 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  26.79 
 
 		 968 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 990 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 944 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 951 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 935 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 915 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  31.11 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 921 aa  79.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 1083 aa  79  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1046 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 991 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  28.15 
 
 		 927 aa  78.2  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1048 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 994 aa  78.2  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 958 aa  78.2  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 845 aa  77.8  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 957 aa  77.8  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 920 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  28.68 
 
 		 1210 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 920 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 906 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 901 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1240 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 924 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 998 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 943 aa  76.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  27.35 
 
 		 986 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 1017 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 929 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 881 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 961 aa  76.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 967 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 888 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 908 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 880 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 923 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 906 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 908 aa  75.1  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 990 aa  74.7  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>