More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6376 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  42.12 
 
 		 932 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  42.32 
 
 		 917 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 920 aa  1875    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 946 aa  248  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 919 aa  231  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 924 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 938 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 933 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 1090 aa  200  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 962 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 901 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 943 aa  188  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 961 aa  184  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 944 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 917 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 853 aa  165  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 957 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 945 aa  163  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 935 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1003 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 888 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 897 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 1051 aa  155  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 897 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 972 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 888 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 941 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 962 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 942 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  24.5 
 
 		 894 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 936 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 1001 aa  141  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 897 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 927 aa  139  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 1004 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 892 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 916 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 957 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 991 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 856 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  31.6 
 
 		 972 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 842 aa  121  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 931 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 836 aa  114  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  22.21 
 
 		 838 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 943 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1077 aa  94.7  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 828 aa  94.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 862 aa  92  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 935 aa  91.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1075 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 747 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 893 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.95 
 
 		 848 aa  79.7  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 746 aa  79  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 924 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 757 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  29.37 
 
 		 897 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 894 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1066 aa  77  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 966 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 798 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 889 aa  74.7  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 892 aa  74.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 772 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 904 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 753 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 845 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1097 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 958 aa  72.8  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 791 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 836 aa  72  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.86 
 
 		 992 aa  71.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 828 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.18 
 
 		 1028 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 795 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.77 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 787 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 918 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1147 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 881 aa  68.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.21 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  33.64 
 
 		 929 aa  68.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 918 aa  68.2  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  31.82 
 
 		 1109 aa  67.8  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1028 aa  68.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.23 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 994 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 948 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 964 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 922 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>