More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4146 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 961 aa  1972    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 919 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 938 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 946 aa  364  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 962 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  28.39 
 
 		 838 aa  257  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 917 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 853 aa  247  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 901 aa  244  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 945 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  25.26 
 
 		 972 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1004 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 746 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 972 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 920 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 925 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 943 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.05 
 
 		 992 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 842 aa  159  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 889 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 944 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 941 aa  155  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 942 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 914 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 1001 aa  148  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 943 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 918 aa  144  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 894 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 936 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 931 aa  138  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 917 aa  131  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 1007 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 986 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 915 aa  129  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 932 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 991 aa  128  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 923 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 921 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 951 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 912 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 957 aa  121  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 951 aa  121  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 951 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 880 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 881 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 888 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 934 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 918 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 948 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 935 aa  114  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 927 aa  114  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 1016 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 933 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 885 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  26.91 
 
 		 941 aa  110  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  26.15 
 
 		 908 aa  109  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 875 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 988 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1236 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 988 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 940 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 939 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 939 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 918 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 977 aa  106  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 906 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.35 
 
 		 940 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 862 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 908 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  27.46 
 
 		 897 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 904 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  26.91 
 
 		 942 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 958 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 892 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 936 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 936 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 978 aa  101  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.36 
 
 		 908 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  25.36 
 
 		 908 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 908 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 961 aa  99.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 878 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 878 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1051 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 878 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 976 aa  98.2  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 859 aa  97.8  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  25 
 
 		 986 aa  97.8  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 878 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 1097 aa  97.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 994 aa  97.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 984 aa  97.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 926 aa  95.9  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 984 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 1090 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 927 aa  95.5  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1083 aa  95.5  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 908 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 931 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>