242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02336 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 889 aa  1814    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 918 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 901 aa  200  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 943 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 917 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 836 aa  194  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 942 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 941 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 944 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 936 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 938 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  23.88 
 
 		 972 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 945 aa  158  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  23.07 
 
 		 919 aa  154  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 842 aa  136  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 961 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  31.48 
 
 		 838 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 962 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 1004 aa  121  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 746 aa  115  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 946 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 972 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 935 aa  99.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 894 aa  98.2  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 880 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 943 aa  92.8  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 994 aa  90.5  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 859 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 915 aa  89.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 957 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 961 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1009 aa  82.8  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 958 aa  82  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 1001 aa  82  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 868 aa  81.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 868 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 936 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 885 aa  77.8  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 936 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 875 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 926 aa  75.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 888 aa  75.5  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 862 aa  74.7  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 920 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 991 aa  74.3  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0809  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 1218 aa  74.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00325409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 878 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 878 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 993 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 881 aa  72.4  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 875 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 932 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1240 aa  72.4  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 943 aa  72  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 944 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 925 aa  71.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 976 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  23.66 
 
 		 1210 aa  71.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1075  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 977 aa  71.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.25 
 
 		 992 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.62 
 
 		 968 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  26.5 
 
 		 897 aa  70.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 927 aa  70.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 933 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 892 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0887  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 1236 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00309149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 916 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  26.74 
 
 		 918 aa  68.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  23.76 
 
 		 986 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 988 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 945 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 984 aa  67.8  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 988 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 934 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 978 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  23.74 
 
 		 942 aa  66.6  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.34 
 
 		 927 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 990 aa  66.6  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1097 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 931 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 870 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 958 aa  65.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.35 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  25.94 
 
 		 1109 aa  65.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1090 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 1077 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 931 aa  65.1  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 957 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 933 aa  64.7  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 869 aa  64.7  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 947 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>