More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2398 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  63.63 
 
 		 917 aa  1234    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 932 aa  1904    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  42.12 
 
 		 920 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 946 aa  248  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 938 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 924 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 919 aa  205  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 962 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 901 aa  204  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 941 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 944 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 935 aa  153  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 972 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 931 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 836 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 917 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 945 aa  134  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 961 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 962 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1004 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 933 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 943 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  29.29 
 
 		 972 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 942 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 927 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 957 aa  125  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  22.77 
 
 		 838 aa  124  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 1090 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 957 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 936 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 1001 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 897 aa  117  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 991 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 943 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 842 aa  109  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1051 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 853 aa  99.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1077 aa  97.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1003 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  31.67 
 
 		 799 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 791 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 922 aa  86.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 772 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 979 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 797 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 759 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 823 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 836 aa  78.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 892 aa  77.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 753 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 856 aa  77.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  26.19 
 
 		 894 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 888 aa  77.4  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 828 aa  77.4  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.61 
 
 		 1109 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.82 
 
 		 992 aa  76.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 897 aa  75.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  26.69 
 
 		 782 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 916 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 888 aa  75.5  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 958 aa  74.7  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 966 aa  74.7  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 862 aa  74.3  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 778 aa  74.3  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 897 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 792 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 753 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 912 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.48 
 
 		 822 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 921 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 889 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 747 aa  72  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1097 aa  72  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 845 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 894 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 814 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 892 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  28.14 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 935 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  27.45 
 
 		 897 aa  70.1  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 798 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 990 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 924 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  27.33 
 
 		 929 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 780 aa  68.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 943 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 977 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 919 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 994 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 809 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.74 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>