More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5340 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  45.63 
 
 		 793 aa  688    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 814 aa  1658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  42.49 
 
 		 881 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  44.5 
 
 		 775 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  43.32 
 
 		 780 aa  648    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  48.2 
 
 		 792 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  58.42 
 
 		 787 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  44.19 
 
 		 790 aa  631  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  43.09 
 
 		 791 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  42.12 
 
 		 772 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  43.04 
 
 		 791 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  41.01 
 
 		 775 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  40.44 
 
 		 800 aa  572  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  40.2 
 
 		 872 aa  562  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 923 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 803 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  37.82 
 
 		 806 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 923 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 789 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  37.15 
 
 		 786 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 804 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 800 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  33.72 
 
 		 917 aa  444  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  33.88 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 874 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 875 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 852 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 753 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 756 aa  277  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.8 
 
 		 888 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 831 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  24.38 
 
 		 866 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 814 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  30.2 
 
 		 906 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  28.79 
 
 		 827 aa  93.2  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 897 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  30.19 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  28.87 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 797 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 933 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1181 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 791 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.58 
 
 		 821 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 779 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1142 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1062 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1024 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1147 aa  74.3  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.58 
 
 		 865 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1089 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1066 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  27.85 
 
 		 802 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 735 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 952 aa  70.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1028 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.78 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 932 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  27.62 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 730 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 962 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1148 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1075 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1104 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1051 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1137 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1079 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1168 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  22.81 
 
 		 860 aa  67.8  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 931 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1095 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1038 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.87 
 
 		 822 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1082 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 982 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 902 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1101 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1059 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1038 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1071 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 793 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 993 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 1058 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 791 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 966 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1129 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1148 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1084 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1175 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1115 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1006 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1085 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>