187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0150 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  39.81 
 
 		 791 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 797 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 771 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 800 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 779 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 777 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  30.51 
 
 		 767 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 792 aa  97.8  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.82 
 
 		 800 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 753 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 872 aa  91.3  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.7 
 
 		 859 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 875 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  27.07 
 
 		 780 aa  84  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 806 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 935 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 923 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 831 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 923 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 791 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 790 aa  78.2  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 874 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 897 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 881 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 804 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  23.13 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  20.59 
 
 		 865 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  23.79 
 
 		 928 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  22.51 
 
 		 775 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  20.7 
 
 		 860 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 932 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 793 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  22.18 
 
 		 888 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  20.17 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 897 aa  67.8  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 966 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 786 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 952 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1036 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 1089 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.96 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 962 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 931 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  20.94 
 
 		 906 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1109 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  25.78 
 
 		 827 aa  62.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1090 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.3 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1126 aa  61.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1147 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 957 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1074 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1120 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1122 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 1087 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 957 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 991 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 730 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1071 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 828 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 753 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 783 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 933 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1074 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 888 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1081 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 749 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 998 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1105 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 962 aa  54.7  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1003 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  23.23 
 
 		 788 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1073 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 828 aa  52.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 743 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.36 
 
 		 972 aa  51.6  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 933 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  25.32 
 
 		 799 aa  51.6  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 920 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 845 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  31.48 
 
 		 381 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1097 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 781 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 759 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 836 aa  50.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1008 aa  50.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.97 
 
 		 833 aa  50.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>