264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2914 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 800 aa  1609    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 803 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 923 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 923 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  35.81 
 
 		 786 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 793 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 814 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 775 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 787 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  32.4 
 
 		 928 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 775 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  32.71 
 
 		 780 aa  445  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  33.29 
 
 		 792 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  31.39 
 
 		 917 aa  442  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  31.38 
 
 		 800 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 772 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 791 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 881 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 790 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 791 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.11 
 
 		 872 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 806 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 789 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 772 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 804 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 753 aa  290  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 852 aa  288  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 874 aa  287  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 875 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 756 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  28.69 
 
 		 888 aa  221  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 831 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  25.95 
 
 		 866 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 814 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  24.36 
 
 		 859 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 897 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  26.93 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.3 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.86 
 
 		 906 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  29.96 
 
 		 827 aa  81.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  27.89 
 
 		 822 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 792 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 771 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  26.54 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  27.23 
 
 		 821 aa  74.3  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1079 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.97 
 
 		 860 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 897 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 793 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  22.76 
 
 		 802 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1127 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 760 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.31 
 
 		 859 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1045 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1147 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1038 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1046 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.03 
 
 		 719 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1016 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1095 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1148 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1105 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 866 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1064 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1020 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 1040 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1059 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1143 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1102 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1129 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1008 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1023 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1100 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1081 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1042 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  30.25 
 
 		 816 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  24.72 
 
 		 1032 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  24.31 
 
 		 803 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1019 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1063 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1103 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  27.59 
 
 		 1095 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  21.93 
 
 		 865 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1082 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1142 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1049 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  28.8 
 
 		 1080 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.22 
 
 		 788 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1109 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1045 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1163 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>