77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0118 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 821 aa  1689    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  59.56 
 
 		 821 aa  1013    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  35.33 
 
 		 802 aa  482  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  33.69 
 
 		 827 aa  469  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 792 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 814 aa  311  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 789 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 806 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 772 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  23.31 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 792 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 923 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 		 872 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 790 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.33 
 
 		 800 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 793 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 831 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 775 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 775 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  24.51 
 
 		 865 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 772 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  25.25 
 
 		 780 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.3 
 
 		 917 aa  66.6  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.71 
 
 		 874 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 814 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 875 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  26.19 
 
 		 928 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  22.02 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.15 
 
 		 859 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  21.9 
 
 		 730 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 806 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 756 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 800 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  28.24 
 
 		 859 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1016 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  29.37 
 
 		 860 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  28.93 
 
 		 895 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  24.57 
 
 		 719 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  20.83 
 
 		 888 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 816 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 814 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 1123 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  21.43 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 786 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 771 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  21.45 
 
 		 767 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  23.35 
 
 		 808 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 887 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 986 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1006 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  21.23 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1010 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1099 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  25.98 
 
 		 906 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.72 
 
 		 714 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 1008 aa  47.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1055 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 874 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 828 aa  47  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 750 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1074 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 1002 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.15 
 
 		 1035 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 848 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.6 
 
 		 1080 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.02 
 
 		 797 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 924 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 1019 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>