More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2180 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  45.63 
 
 		 814 aa  688    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  59.97 
 
 		 790 aa  1005    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  57.9 
 
 		 872 aa  937    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 793 aa  1601    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  61.66 
 
 		 791 aa  1036    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  45.58 
 
 		 772 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  44.54 
 
 		 775 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  62.15 
 
 		 780 aa  1031    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  45.37 
 
 		 792 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  44.29 
 
 		 787 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  43.83 
 
 		 881 aa  657    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  41.65 
 
 		 775 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  40.57 
 
 		 800 aa  606  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 923 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 791 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 923 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  39.24 
 
 		 803 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  38.42 
 
 		 786 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  37.24 
 
 		 917 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  35.61 
 
 		 928 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  36.41 
 
 		 804 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 806 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 800 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 789 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 852 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 772 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 875 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 874 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 753 aa  359  8e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 756 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 831 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.4 
 
 		 888 aa  210  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  21.78 
 
 		 866 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.9 
 
 		 859 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  20.68 
 
 		 814 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 701 aa  106  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  20.42 
 
 		 865 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  29.15 
 
 		 821 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.48 
 
 		 897 aa  99  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  19.22 
 
 		 860 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.91 
 
 		 906 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  20.86 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  18.93 
 
 		 859 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  31.07 
 
 		 803 aa  81.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.92 
 
 		 779 aa  80.1  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.91 
 
 		 719 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  24.52 
 
 		 791 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1089 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 935 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 797 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 962 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 865 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  24.92 
 
 		 802 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  21.91 
 
 		 822 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 818 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 730 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  24.19 
 
 		 827 aa  68.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 993 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1036 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 1095 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 1087 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1070 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 807 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 1075 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.42 
 
 		 1025 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 966 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1028 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 902 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1137 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1117 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 1173 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  25.95 
 
 		 848 aa  60.8  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1056 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1020 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 763 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1182 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1086 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.18 
 
 		 914 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.9 
 
 		 972 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 809 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1063 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  23.16 
 
 		 1111 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  24.43 
 
 		 846 aa  58.9  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 976 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 952 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 920 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 986 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 1035 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>