129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0255 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 852 aa  1734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  37.97 
 
 		 775 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 772 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 790 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 775 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 787 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 881 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 792 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 791 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 789 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  33.38 
 
 		 780 aa  412  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 806 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 814 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  34.25 
 
 		 800 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 874 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 872 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 804 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 772 aa  360  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 923 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 923 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 875 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 803 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 791 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 753 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 800 aa  286  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 928 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.37 
 
 		 917 aa  278  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 786 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 831 aa  227  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 756 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.75 
 
 		 888 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  23.16 
 
 		 866 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 771 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  25.67 
 
 		 906 aa  81.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  20.85 
 
 		 902 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.31 
 
 		 860 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.01 
 
 		 865 aa  77.8  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.44 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 800 aa  74.3  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.99 
 
 		 859 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 797 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  27.12 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  22.22 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  26.34 
 
 		 767 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.62 
 
 		 822 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1142 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1163 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 897 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 935 aa  65.1  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1090 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1129 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  23.48 
 
 		 802 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1186 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 814 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.91 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  22.51 
 
 		 1164 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1089 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 932 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 1153 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1130 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  22.58 
 
 		 1173 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1160 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1148 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1094 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  26.43 
 
 		 799 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 1102 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1129 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1109 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 1148 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 1189 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1119 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 1122 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1152 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 776 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 1202 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1114 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 1095 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 993 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 730 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1188 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 833 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1150 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 818 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 952 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 760 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  22.76 
 
 		 788 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  22.83 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1144 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 933 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1163 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1119 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1014 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  20.4 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 933 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 1153 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1175 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 		 1038 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>