189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3693 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  42.49 
 
 		 814 aa  640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  41.66 
 
 		 792 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  62.88 
 
 		 772 aa  1025    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  42.24 
 
 		 790 aa  639    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  43.83 
 
 		 793 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 881 aa  1796    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  52.06 
 
 		 775 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  50.99 
 
 		 775 aa  841    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  43.17 
 
 		 787 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  42.67 
 
 		 791 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  41.99 
 
 		 780 aa  617  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  39.84 
 
 		 800 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  35.56 
 
 		 872 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 923 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 806 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 		 789 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  38.2 
 
 		 804 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 791 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  34.58 
 
 		 928 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 923 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 803 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 874 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 875 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  32.83 
 
 		 917 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 786 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 772 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 852 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 800 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 756 aa  323  9.000000000000001e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 831 aa  247  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.72 
 
 		 888 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  24.62 
 
 		 866 aa  171  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.22 
 
 		 859 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  22.68 
 
 		 860 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.37 
 
 		 859 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  19.77 
 
 		 902 aa  98.6  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  21.42 
 
 		 906 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 		 897 aa  97.8  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 814 aa  97.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 779 aa  92.8  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  23.16 
 
 		 791 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1142 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  28.1 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1176 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  20.82 
 
 		 701 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  22.97 
 
 		 822 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1148 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.71 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  20.9 
 
 		 865 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1138 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1102 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 897 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  27.17 
 
 		 802 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  25.81 
 
 		 767 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1198 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1189 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1166 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 865 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 730 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  22.15 
 
 		 1188 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 1237 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1109 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1199 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  27.11 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1148 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  29.7 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1168 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 1144 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  22.82 
 
 		 1146 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  21.32 
 
 		 781 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1094 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1098 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 800 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1122 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 1106 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  22.8 
 
 		 1116 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1169 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 781 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 1090 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 771 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1127 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  22.49 
 
 		 1164 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 716 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1205 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1129 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1153 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 1219 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 1127 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  28.71 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  23.19 
 
 		 1103 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1220 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  22.57 
 
 		 1086 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 1148 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1150 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  28.09 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  21.74 
 
 		 1192 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  26.14 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>