More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2272 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 814 aa  1638    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  32.58 
 
 		 827 aa  343  8e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  29.24 
 
 		 802 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 821 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  29.51 
 
 		 821 aa  315  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 792 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  21.58 
 
 		 923 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 831 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 803 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 800 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 806 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 790 aa  117  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 814 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 789 aa  114  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  23.2 
 
 		 800 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 791 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  20.78 
 
 		 793 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 792 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 787 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  23.77 
 
 		 872 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  20.99 
 
 		 780 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 775 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 881 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 923 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 772 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 797 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 791 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 874 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 775 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 928 aa  88.6  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 897 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.67 
 
 		 888 aa  88.2  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  29.89 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  46.96 
 
 		 957 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.56 
 
 		 917 aa  84.3  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 966 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 772 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 771 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 786 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 1089 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  20.07 
 
 		 800 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 875 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  30.04 
 
 		 833 aa  75.1  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 779 aa  74.3  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 759 aa  74.3  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 922 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 760 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 1087 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 716 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  24.37 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  26.89 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 935 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 924 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 760 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1082 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1122 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1126 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1147 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 927 aa  68.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 933 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  27.27 
 
 		 906 aa  68.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 735 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 991 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 933 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  26.05 
 
 		 822 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  37.37 
 
 		 856 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1147 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1066 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1027 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 852 aa  65.1  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1058 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1028 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 781 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 776 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1040 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 1038 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1119 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1177 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1062 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1148 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 924 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1104 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 828 aa  62  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  45.45 
 
 		 1514 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  30 
 
 		 1074 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1075 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 865 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 794 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>