119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0595 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  100 
 
 		 729 aa  1480    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  54.37 
 
 		 781 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  77.43 
 
 		 730 aa  1164    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  53.72 
 
 		 781 aa  757    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  86.15 
 
 		 727 aa  1286    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  85.46 
 
 		 743 aa  1280    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  46.58 
 
 		 708 aa  614  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  48.12 
 
 		 707 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  44.84 
 
 		 757 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  43.37 
 
 		 766 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  40.5 
 
 		 730 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 749 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 871 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  22.13 
 
 		 777 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.38 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.27 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 897 aa  64.3  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 814 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 935 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 779 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 836 aa  61.6  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 		 626 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  20.83 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 993 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  36.07 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 952 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  27.75 
 
 		 739 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 		 753 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  22.22 
 
 		 888 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  28.44 
 
 		 747 aa  53.9  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 850 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1069 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 845 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 699 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.34 
 
 		 917 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.61 
 
 		 690 aa  52.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 897 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.68 
 
 		 686 aa  51.6  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 706 aa  51.6  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.31 
 
 		 764 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 621 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 828 aa  51.2  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.11 
 
 		 807 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.53 
 
 		 728 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 991 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 684 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 707 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  23.21 
 
 		 872 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  22.32 
 
 		 680 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.47 
 
 		 677 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.89 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 681 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 705 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  36.99 
 
 		 1001 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  25.87 
 
 		 737 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.18 
 
 		 653 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  36.67 
 
 		 966 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.54 
 
 		 737 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 671 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 699 aa  48.9  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 702 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  20.88 
 
 		 758 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 1089 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.36 
 
 		 865 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 649 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 707 aa  48.1  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 681 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.08 
 
 		 764 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.44 
 
 		 696 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 775 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 621 aa  47.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  20.43 
 
 		 792 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 651 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 736 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 713 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 680 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  27.78 
 
 		 730 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 791 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 757 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  20.85 
 
 		 997 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 426 aa  46.6  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.33 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 791 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.81 
 
 		 716 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  21.9 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.84 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  21.12 
 
 		 875 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1016 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 743 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>