113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1438 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 928 aa  1872    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  52.42 
 
 		 917 aa  964    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  41.01 
 
 		 923 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  41.77 
 
 		 923 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  36.69 
 
 		 803 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 881 aa  503  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 775 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  37.66 
 
 		 775 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  34.75 
 
 		 780 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 793 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 790 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  34.18 
 
 		 800 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  35.04 
 
 		 872 aa  469  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 772 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 800 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 791 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  33.29 
 
 		 792 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 791 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 814 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 789 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 806 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 804 aa  353  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 874 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 875 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 772 aa  333  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 852 aa  287  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 753 aa  270  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 756 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 831 aa  177  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  21.7 
 
 		 888 aa  149  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  20.72 
 
 		 906 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  20.36 
 
 		 865 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  20.29 
 
 		 859 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 814 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.79 
 
 		 822 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 771 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  21.46 
 
 		 866 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  20.07 
 
 		 777 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  19.51 
 
 		 860 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 865 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.82 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  26.19 
 
 		 821 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 993 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1117 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  20.8 
 
 		 701 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  24.9 
 
 		 802 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  21.8 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1051 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  19.35 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.83 
 
 		 779 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  19.79 
 
 		 1168 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 708 aa  55.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  21.72 
 
 		 767 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  20.5 
 
 		 902 aa  55.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  22.22 
 
 		 827 aa  54.7  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  20.23 
 
 		 828 aa  54.7  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  19.01 
 
 		 897 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  19.54 
 
 		 1106 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 1037 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 935 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  22.63 
 
 		 781 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 800 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  25 
 
 		 572 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.96 
 
 		 707 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  20.17 
 
 		 1153 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  21.8 
 
 		 730 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  20.7 
 
 		 1148 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 1042 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1128 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 		 1006 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  22.38 
 
 		 1066 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 1123 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1038 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 897 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 1028 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1050 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 		 1030 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  20.31 
 
 		 1154 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  19.06 
 
 		 1128 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1086 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  18.75 
 
 		 1117 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 757 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 735 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 1095 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  21.17 
 
 		 1102 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  21.69 
 
 		 1177 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  19.9 
 
 		 1122 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  20.72 
 
 		 1103 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 993 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  20.92 
 
 		 836 aa  45.8  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 743 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1115 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 1089 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  18.73 
 
 		 1087 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 1154 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>