214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4389 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  52.66 
 
 		 775 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  52.06 
 
 		 881 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  53.8 
 
 		 772 aa  875    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 775 aa  1583    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  41.65 
 
 		 793 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  41.83 
 
 		 791 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  41.91 
 
 		 787 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  39.95 
 
 		 792 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  40.12 
 
 		 790 aa  605  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  41.07 
 
 		 800 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  41.01 
 
 		 814 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  39.26 
 
 		 780 aa  589  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  38.8 
 
 		 923 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  38.17 
 
 		 872 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 791 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  36.98 
 
 		 923 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  37.62 
 
 		 804 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  36.16 
 
 		 789 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 806 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 874 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  37.66 
 
 		 928 aa  482  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  36.33 
 
 		 917 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 803 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  33.38 
 
 		 800 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 786 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 772 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 852 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 875 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 753 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 756 aa  303  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 831 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.45 
 
 		 888 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  24.4 
 
 		 866 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  25.19 
 
 		 859 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 897 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  22.16 
 
 		 860 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.58 
 
 		 859 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  27.42 
 
 		 906 aa  97.8  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  24.09 
 
 		 865 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 814 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  21.84 
 
 		 779 aa  77.8  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.24 
 
 		 791 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 701 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  23.68 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  22.51 
 
 		 822 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 792 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  25.86 
 
 		 802 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 897 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 797 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1122 aa  70.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  29.36 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1126 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 902 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.86 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1109 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 865 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 888 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 935 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  32.91 
 
 		 816 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 993 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1105 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 771 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 800 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  25.46 
 
 		 914 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1089 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1105 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 845 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 993 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1232 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 952 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 1114 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1123 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 997 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1023 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1051 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 833 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 759 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 998 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1036 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 861 aa  55.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 757 aa  55.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1181 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 1206 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 748 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 719 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 763 aa  54.7  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1066 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 982 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 772 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 1028 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1102 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 1105 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 1087 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 966 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 1066 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 730 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>