109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4373 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  79.88 
 
 		 729 aa  1140    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  53.5 
 
 		 781 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1486    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  52.57 
 
 		 781 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  77.26 
 
 		 727 aa  1165    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  77.26 
 
 		 743 aa  1169    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  46.44 
 
 		 708 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  48.09 
 
 		 707 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  44.1 
 
 		 757 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  42.76 
 
 		 766 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  40.89 
 
 		 730 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 749 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 		 871 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 110 aa  69.7  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22 
 
 		 791 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 814 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 888 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 897 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 935 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 952 aa  57.4  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 993 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  23.37 
 
 		 822 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 699 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 681 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.29 
 
 		 764 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  22.24 
 
 		 753 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.98 
 
 		 750 aa  53.9  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.02 
 
 		 997 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  33.88 
 
 		 673 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.59 
 
 		 686 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 897 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  35.8 
 
 		 966 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 650 aa  53.5  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  22.98 
 
 		 764 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 675 aa  52  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 850 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 681 aa  51.2  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  22.51 
 
 		 706 aa  51.2  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  21.01 
 
 		 917 aa  50.8  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  20.97 
 
 		 772 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 791 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1069 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  22.34 
 
 		 888 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  21.67 
 
 		 1001 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 836 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  21.65 
 
 		 772 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.55 
 
 		 653 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  20.76 
 
 		 705 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 699 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 775 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 723 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 671 aa  48.9  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 702 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  26.07 
 
 		 739 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 815 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  21.9 
 
 		 874 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  39.73 
 
 		 859 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 724 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 712 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 757 aa  47.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 724 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 676 aa  47.4  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 723 aa  47.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.81 
 
 		 677 aa  47.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 621 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 777 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 791 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 828 aa  47.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 719 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  26.55 
 
 		 641 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 1016 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.08 
 
 		 867 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 784 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1120 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.06 
 
 		 721 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  23.66 
 
 		 860 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  23.72 
 
 		 652 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  20.73 
 
 		 872 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 681 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 688 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 771 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 678 aa  45.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 697 aa  45.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 689 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.33 
 
 		 706 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 618 aa  44.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 720 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.66 
 
 		 859 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 707 aa  44.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 720 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>