72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1415 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  100 
 
 
871 aa  1786    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
749 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 
781 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 
781 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
708 aa  85.1  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.52 
 
 
1195 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  29.46 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
1149 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.53 
 
 
707 aa  81.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  31.6 
 
 
1194 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  32.17 
 
 
1075 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.72 
 
 
1257 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
1123 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
1232 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 
1105 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 
730 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
888 aa  71.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  21.47 
 
 
729 aa  72  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  28.7 
 
 
986 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
952 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  24.05 
 
 
730 aa  68.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
1114 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.67 
 
 
1125 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
1153 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.88 
 
 
1162 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.77 
 
 
1132 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 
766 aa  65.1  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  32.31 
 
 
1141 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
1176 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
1105 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.48 
 
 
1075 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.41 
 
 
1162 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.2 
 
 
1173 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  21.06 
 
 
997 aa  61.6  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  29.55 
 
 
1122 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
1123 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
1188 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29 
 
 
935 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
1206 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
1167 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
757 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 
1066 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
993 aa  58.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.39 
 
 
1298 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.98 
 
 
1161 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  30.4 
 
 
1069 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  23.21 
 
 
799 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
1087 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.81 
 
 
1203 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  23.26 
 
 
994 aa  54.3  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  36.08 
 
 
966 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
1041 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
743 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  23.53 
 
 
979 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
727 aa  51.6  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  23.44 
 
 
1067 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.14 
 
 
1052 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.62 
 
 
1001 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25 
 
 
1071 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
1007 aa  48.5  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.9 
 
 
1122 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.9 
 
 
1120 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  20.81 
 
 
818 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.48 
 
 
1126 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
1065 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
966 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 
798 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  38.14 
 
 
1194 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 
636 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 
897 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 
1054 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 
791 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>