124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0509 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  85.05 
 
 		 729 aa  1244    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  56.23 
 
 		 781 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  77.4 
 
 		 730 aa  1172    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  52.78 
 
 		 781 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  97.8 
 
 		 727 aa  1417    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 743 aa  1517    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  47.86 
 
 		 708 aa  616  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  47.68 
 
 		 707 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  42.95 
 
 		 766 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  43.95 
 
 		 757 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  40.73 
 
 		 730 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 749 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  23.46 
 
 		 626 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 888 aa  67.4  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  41.57 
 
 		 110 aa  66.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 935 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  36.89 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.04 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 772 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  29.67 
 
 		 739 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.73 
 
 		 791 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.77 
 
 		 888 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.16 
 
 		 1001 aa  59.3  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.22 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 897 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 897 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 779 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  28.15 
 
 		 747 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 706 aa  55.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 621 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  27.59 
 
 		 737 aa  55.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 993 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.18 
 
 		 917 aa  54.7  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 836 aa  54.7  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 875 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.6 
 
 		 1007 aa  54.3  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 706 aa  53.9  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 699 aa  53.9  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.32 
 
 		 686 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 966 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 676 aa  53.9  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 649 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 814 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  21.5 
 
 		 997 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 871 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  21.67 
 
 		 772 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 675 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 815 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  21.47 
 
 		 822 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 671 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 699 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  26.28 
 
 		 702 aa  51.6  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 805 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.66 
 
 		 716 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 707 aa  51.2  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 426 aa  50.8  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 813 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1069 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 681 aa  49.7  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.34 
 
 		 737 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 791 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.84 
 
 		 690 aa  49.3  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 712 aa  49.3  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25 
 
 		 807 aa  48.5  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 712 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 952 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.37 
 
 		 865 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.76 
 
 		 697 aa  48.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  20.61 
 
 		 923 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 713 aa  47.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.26 
 
 		 728 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 991 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.57 
 
 		 766 aa  47.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  20.89 
 
 		 874 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 757 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  20.28 
 
 		 699 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  22.15 
 
 		 881 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  20.72 
 
 		 806 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 693 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 697 aa  47.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.88 
 
 		 810 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 680 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 662 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.13 
 
 		 653 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 651 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  25.46 
 
 		 777 aa  46.6  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  26.59 
 
 		 764 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  34.25 
 
 		 994 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  20.19 
 
 		 705 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  28.57 
 
 		 848 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  23.17 
 
 		 683 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 850 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1016 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  23.18 
 
 		 618 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.51 
 
 		 755 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.52 
 
 		 739 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 847 aa  45.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>