271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0308 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 791 aa  1602    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 762 aa  224  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 781 aa  220  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 790 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 747 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 753 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 777 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 808 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 792 aa  183  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 738 aa  177  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 738 aa  177  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 792 aa  174  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 772 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 765 aa  161  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 768 aa  145  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 766 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.57 
 
 		 760 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.96 
 
 		 768 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 777 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 768 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.14 
 
 		 760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 780 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 747 aa  130  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 796 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 746 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 814 aa  120  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 799 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 782 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 828 aa  98.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 815 aa  98.2  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.24 
 
 		 766 aa  97.8  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 729 aa  97.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 835 aa  94  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  20.99 
 
 		 786 aa  88.6  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 781 aa  82.4  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 736 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 756 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  22.8 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 841 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 798 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.57 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.93 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.42 
 
 		 640 aa  71.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 700 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 815 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  24.91 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  25.56 
 
 		 699 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  25.17 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 724 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  26.79 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  20.82 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  20.82 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 713 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 724 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  23.71 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  24.85 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.07 
 
 		 734 aa  58.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 706 aa  57.4  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 770 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 708 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 711 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 731 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 826 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 701 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 721 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 729 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 727 aa  55.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 662 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 614 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  24.77 
 
 		 696 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 825 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 853 aa  55.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 725 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  24.77 
 
 		 696 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.27 
 
 		 709 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 717 aa  55.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 755 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 734 aa  55.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 694 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 746 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 764 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 649 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 766 aa  54.7  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 696 aa  54.7  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 725 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 722 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 686 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 665 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>