67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2634 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 814 aa  1672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 738 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 738 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 753 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  32 
 
 		 768 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 768 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 792 aa  319  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 777 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 747 aa  293  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 766 aa  286  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 777 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 772 aa  261  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 835 aa  241  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 762 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 772 aa  141  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 768 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 782 aa  135  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 796 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 786 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 791 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 781 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 729 aa  114  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 792 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 780 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.31 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 815 aa  103  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.75 
 
 		 760 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 828 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 808 aa  95.1  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 735 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 735 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 747 aa  74.3  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 765 aa  73.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.89 
 
 		 766 aa  71.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 736 aa  67.4  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 841 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  23.42 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  23.55 
 
 		 734 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 798 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 756 aa  54.3  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 942 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  26.22 
 
 		 740 aa  50.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 754 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 754 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  37.61 
 
 		 1027 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  24.72 
 
 		 730 aa  48.1  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 711 aa  48.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 681 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 799 aa  47.8  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 958 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 799 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  23.72 
 
 		 744 aa  45.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 790 aa  45.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 760 aa  45.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 786 aa  45.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  23.74 
 
 		 778 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 778 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  22.1 
 
 		 741 aa  44.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>